小智和皮卡丘等一行伙伴在旅途中前行。某日，宝可梦波尔凯尼恩从天而降并被迫与小智锁在了一起。波尔凯尼恩与被人类伤害过的宝可梦们共同生活，因此非常讨厌人类，但这条神奇的锁链却让他们无法分开，奇妙的故事就此开始。小智与皮卡丘又将一起开始新的冒险…… 另一方面，在超级机关城市阿佐特王国，大臣贾维斯得到了常年追求的终极发明——500 年前诞生于阿佐特王国的人造宝可梦玛机雅娜。据说在玛机雅娜体内，有被称为 “魂心”的未知力量，贪婪又邪恶的贾维斯企图利用这股力量来统治王国。小智和波尔凯尼恩将会如何化解彼此的嫌隙？波尔凯尼恩与玛机雅娜又有着怎样的渊源？他们要如何共同对抗贾维斯拯救阿佐特王国？玛机雅娜的最终命运又将如何结局？一场精灵宝可梦史上最伟大的战役即将展开！

宝可梦是与我们共同生活在这个星球上不可思议的生物。目标与最强王者丹帝对战的小智，以及梦想收服所有宝可梦并追寻梦幻的小豪，二人以樱木研究所特别调查员的身份出发，在不同地区展开调查，邂逅了各种各样不可思议的宝可梦，还在旅途中收服了新的搭档。

影片讲述的是一群疯狂的科学家，为了自己的梦想，研制出一套只需要少许基因便可复制出宝可梦的机器，并把发掘到的世界最强宝可梦复制成了拥有比梦幻更强能力的超梦。但当超梦醒来后，却因无法找寻到真正的自我而暴走。火箭队的老大出现在超梦的面前，用花言巧语把迷失自我的超梦拉拢过来为自己办事，但没过多少时间，超梦再次对自我感到迷茫。超梦回到复制自己的岛屿，决定开始它的复仇之战。与此同时，小智和皮卡丘等一行人接收到了一封神秘人的邀请函，邀请参加世界最强的宝可梦训练家宴会。等他们穿过了狂风暴雨的海岸终于到达了新岛时，没想到在大家面前出现的竟然是超梦。

新作“Extra Stage2～旅立的主要角色为池谷浩一郎和佐藤真子。半年前，池谷和其心仪的真子有个约会，可池谷却因迟到而没有见到真子，有着如此悲痛过去的池谷没有机会道歉，而半年时间就这样过去。故事发生在藤原拓海所属车队ProjectD与东堂塾在盐谷比赛的时候，池谷在关越自动车道的服务区偶然和碓冰峠最强组合“真子&沙雪”再会。因半年前的迟到而耿耿于怀的池谷这次终于下定决心要和真子道歉，可真子却先说有话要和池谷说，于是两人再次约定相见。当日，池谷为了不再重滔复撤而提前2个小时达到约定的地方，这时池谷遇上了一名迷路的老人。出于良心他送老人到了北轻井泽，而倒霉的池谷的车行至旧碓井峠的时候却发生爆胎事故。那么最终池谷能否和真子见面呢？

2007年，美国研制并发售了一款名为"The World"的网络游戏。很快，全世界有2000万人成为其忠实的玩家。该游戏采用即时战斗的形式，舞台为架空的幻想世界。游戏中，一共有剑士、重剑士、重斧士、咒文师、重枪士和双剑士6种职业，每种职业都有男女之分，玩家可以按照自己的喜好找到适合自己的角色。故事是发生在名为"The World"的线上游戏的幻想世界之中。在游戏世界中发生了原因不明的问题，无法登出的玩家司与不正常存在的猫型角色(玛哈)的关系，造成维护正常游戏的玩家自治团体"红衣骑士团"的注意并将其视为危险人物而追踪著。司在与游戏内认识的朋友蜜蜜尔、大熊的协助下想找回登出的方法，之后探索"The World"之中的种种谜团并遭遇各式各样的事件。