《护国军魂传奇》讲述重九起义后蔡锷及家人被袁世凯“请”到京城，扣为人质，蔡锷在看清袁世凯真面目后，破除重重困难，经日本，转台湾、香港地区，再过越南，最终返回云南反袁的故事 .1911年10月30日，蔡锷在云南发动重九起义，响应武昌起义，大清朝终于在众多有识之士的努力下，落下了帷幕。

在小小的白马城，居住着两个情投意合的好哥们儿龚少爷（谢霆锋 饰）和巴少爷（张家辉 饰），二人携手报名当捕快，无奈虽然空有一身本领和远大志向，却只能委身厨房洗衣间，做一名任人驱使任任打骂的实习捕快。这一日，城中大户张员外家进入强梁，全家老小悉被杀害，无一幸免，家中价值连城的白玉观音也不知去向。龚少爷勘查现场，对凶手作出了正确的推断。虽然被率领十二金衣捕快的神捕头铁无情（何家劲 饰）采纳，结果反被同一衙门的前辈屈打成招，问下死罪。幸而在牢中结识了“Twins侠盗”水龙女（黄奕 饰）和火龙女（蔡卓妍 饰），一番打斗后终于逃出生天。 为了追查白玉观音的下落，他们一路前往关外的财神客栈，一段江湖传奇就此展开……

影片主要讲述了大清年间，长白山有棵千年人参王，吃了它可以根治百病，皇上派遣各地官员沿途护送进京为太后祝寿，此时许多百姓染上瘟疫，伍四六冒死盗取人参救村民，为了报仇白正峰要杀伍四六，麻翠姑等人受重伤的故事。

抗战时期，怀揣爱国之志的青年高天行立身旧上海，欲凭一己之力抗日救国。高天行在一次行动中结识了行走江湖的任非常，两个年轻人惺惺相惜，结为兄弟，屡次与敌奋战，立下奇功。国民党和日方均想方设法收编二人。正当其时，共产党员江泮的出现，为两个年轻人开启了一盏指路明灯。然而，在各种考验面前，高天行与任非常二人渐行渐远，选择了不同的人生之路。以自我为中心的任非常虽有孔武之力，却终因自私狭隘的胸襟众叛亲离，成为民族罪人，葬送了自己的前程和幸福；而热血青年高天行在江泮的引领下，认清时局，辨明是非，完成了个人身份的转换和成长，走上了革命征程。

1943年秋，日伪苏城清乡总指挥李世林因侵吞军饷败露，被日军毒杀。李的亲信秘书戴遂昌侥幸躲过捕杀，逃跑途中被我新四军武工队在我湖山根据地擒获。由于戴遂昌掌握了日军在苏城地区的军事部署和日伪与国民党顽固派暗中勾结的证据，军分区命令我湖山县委务必保证戴的安全，三天后派部队来转移戴遂昌。日军苏城宪兵司令部派出秘密行动组潜入湖山追捕戴遂昌；国民党顽固派恐其与日伪勾结的阴谋败露，秘令苏城特派员顾维民全力营救戴遂昌，营救不成则秘密除掉；而潜伏在湖山的日伪内奸也受命启动。我湖山县委保卫科长沈英杰受命保护戴遂昌，他和他的战友在三天中与日军、国民党顽固派和潜伏的日伪内奸展开了一系列惊心动魄的搏杀，最终完成了任务。