月球探测器在月亮上捕捉到了白影，大雄认为这道白影是月亮上的兔子，惹来了大家的耻笑，于是哆啦A梦为了帮助大雄，利用道具“异说俱乐部徽章”，在月球背面制造了一个兔子王国。一天，神秘少年露卡转学而来，与大雄和伙伴们一同前往月亮上的月兔王国展开了一场别开生面的浪漫想象力之旅。

这是一部以没有唱片，也没有演唱会的乡村为舞台，描写以说唱歌手为目标的青年们的奋斗故事。剧情紧接第一部的结尾，大威为了逐梦，告别了一宫和汤姆，来到东京打拼。而在两年之后，他只不过是某个嘻哈团体里的无名小卒，只能负责跑腿打杂。从来没有上台演出机会的他，在被团体中的前辈欺骗之后终于爆发，不得已离开了团体。跑到枥木县的大威早已放弃了说唱梦想，为了生存已经另谋生路在一家汽修行帮忙。但是他却被迫卷入了老板突发奇想出来的音乐节策划工作，不知不觉间，熄灭的梦想再一次燃起，并与过去的伙伴们的一宫和汤姆再会。但好景不长，大威再一次遇到了危机，急需大量的钱。无计可施的他抢走了售票处的钱箱，打算逃走，却被熟悉的歌声吸引了回来……

2012年2月，东京铁塔上空出现了巨大的数码蛋。就在本宫大辅（20岁）和V仔兽修行拉面技艺的时候，遇到了虽然拿着有裂纹的数码器，但身边没有搭档数码兽的迷之青年——自称“我没有数码兽，我的搭档数码兽被我杀了，我是世界上最初和数码兽建立搭档关系的人类。”

相河一辉（高桥一生饰）在大学教授研究动物行为的“动物行为学”，半年前刚开始讲师的生活，但是他太喜欢各种生物，沉迷于研究，甚至不遵守大学的规则，每天都在职场挨批，而且他不太遵守时间，还被牙医吐槽没常识。一辉非常诚实，有时对学生的提问直接回答不知道，让学生困惑，他坚持兴趣，不守固定观念的样子也影响了身边人的价值观。

宝可梦是与我们共同生活在这个星球上不可思议的生物。目标与最强王者丹帝对战的小智，以及梦想收服所有宝可梦并追寻梦幻的小豪，二人以樱木研究所特别调查员的身份出发，在不同地区展开调查，邂逅了各种各样不可思议的宝可梦，还在旅途中收服了新的搭档。