超人们告别了小宅从过去回到现在，继续守护星星球。然而现在的星星球有更大危机等着他们：司令寄给大怪一个神奇的披风，能拿出很多道具增强怪兽的能力，好让大大怪和小小怪更容易侵略星星球！ 为了应付这个危机，超人也继续在超星学院提升自己的技能，更好地守护这个星球。同时，一直离开的战神伽罗因被宇宙神医——医神复活，重新回到超人的团队，与小心超人一起并肩作战，大家一起守护星星球！

星星球的人们发现了一个新星球（古灵星），它是一颗神秘的星球，上面蕴含着各种神秘的资源。校长和博士率领五个超人去探险，他们无意中探入了古灵星的地下城，探秘失落的文明。灰心星球司令派大小怪在探险队卧底，随时窃取探险（即能源石）的成果，并带回灰心星球。超人们一边应付新环境，一边应付来自暗处的各种破坏。《开心宝贝之古灵星历险记》为《开心宝贝》系列第六部，整部动画延续了前几部的诙谐幽默。