原本即将征服世界的魔王撒旦却遭勇者击败，被迫漂流到异世界「日本」。为了赚取生活费，魔王将三坪大的公寓当成临时魔王城，开始过着打工族的生活。没想到勇者竟追随他的脚步穿越时空而来，一出平民路线的奇幻故事就此展开！

2022年，天才编程者茅场晶彦所开发的世界最早的完全潜行专用装备设备《NERvGear》。 　　这个革命性的机器给VR（假想现实）世界带来了无限的可能性。那之后经过了4年。。。。。 　　《NERvGear》的后继品VR机为了对抗《AmuSphere》（第二代民用完全潜行机），发售了一个次世代的可穿戴设备《Augma》 　　替换了完全潜行机能，是一个对AR（增强现实）功能进行了最大限度扩大的最先进机种。 　　由于《Augma》在觉醒状态下也可以安全和便利地使用，因此一瞬间便在玩家当中传开了。 　　这个杀手级内容，被叫做《Ordinal Scale序列之争（OS）》，是《Augma》专用的ARMMO RPG。 　　亚斯娜和伙伴们会玩的这个游戏，桐人也准备参战了。。。。

故事设定在一个身怀魔力的人类濒临灭绝的世界，武力的最高境界从使用利剑，转而到使用魔法，继而变成了使用枪械。就读于培训用以取缔残存魔力威胁的“异端审问官”专业机关——“对魔导学园”的男主角草薙哮，是个完全不会使用枪械，只靠一柄刀与敌人交锋的另类。而他率领的第35试验小队又被称为“杂鱼小队”，顾名思义是由一群劣等生拼凑而成的团队。某一天，拥有“魔女猎人”资格的超精英持枪高手凤樱花，竟然加入了这支队伍。在带领队员动身执行回收魔导遗产的任务中，一场学园动作奇幻大作就此开始。

在恋爱模拟游戏的世界中被称为“攻陷之神”的少年桂木桂马，意外地与来自冥界的恶魔少女艾鲁西结成了地狱的契约，为了捕获躲藏在女性的心灵空隙间的“驱魂”而开始攻略现实世界的女性。动画第3季的剧情主线是从原作漫画第7卷开始的长篇故事“女神篇”。

在新生ALO中，桐人、亚丝娜和结衣谈到了鲸鱼，从没有见过鲸鱼的结衣对鲸鱼非常感兴趣，为了帮助结衣桐人想到了新生ALO中海边的任务。不料直叶却不会游泳，为了能正常进行海边的任务大家决定对直叶进行游泳特训。与此同时，桐人被菊冈诚二郎以“心理咨询”的名义骗至心理咨询室，并从桐人处详细调查了“SAO”和“ALO”等事件。桐人离开菊冈诚二郎处后登入新生ALO与大家一起进行了“深海掠夺者”的任务，最终返回时结衣如愿以偿地见到了鲸鱼。后桐人再次接到了菊冈诚二郎的电话。（打算委托桐人调查“GGO”，此时剧情进入“幽灵子弹篇”）