地球已经很久没有遭受怪兽的侵害了，似乎恢复了和平。人类将目光进一步转向宇宙，因此对抗怪兽灾难的队伍规模也在逐步缩小。而就在这时，神秘宇宙漂浮体“斯菲亚”突然向地球发动攻击。地球与宇宙的联系被斩断，变成了“孤独的行星”。斯菲亚的恶魔之手也逼近了主角明日见奏大的日常生活，它不停地破坏，最终从漂浮体变成了巨大的形态……奏大不顾危险、勇敢地挑战敌人，终于变身成德凯奥特曼。“就是现在，上吧！”奏大手握德凯奥特曼的“光”，为了保护昔日的和平奋勇迎战。为了对抗斯菲亚，新精英队“GUTSSELECT”重新建立。奏大作为新“精英胜利队”的新队员，与年轻的伙伴们一起对抗巨大的敌人。

跨越时空苏醒的光之巨人特利迦奥特曼，苏醒了！3000万年前，一股黑暗力量使世界陷入恐惧。最后是光之巨人将黑暗封印到了遥远的宇宙中。不过，光之巨人也用尽了自己的力量，在红色星球上陷入了长眠。时光流转，地球和平同盟“TPU”在地球组建了精英小组“精英胜利队”。主人公真中剑悟生活在新开拓的火星上，他有一个梦想，就是守护大家的笑容。剑悟平日里在植物研究中心工作，他是名植物学家。最近他总是重复做一个恶梦，梦里总出现一名神秘的巨人，这让他十分苦恼。有一天，超古代封印的黑暗突然再次来袭，打破了火星安稳宁静的生活。当火星的街道被怪物破坏时，剑悟在命运的引导下，和沉睡的光之巨人相遇了。这次相遇会给他和地球带来怎样的影响呢？

最后一场战斗已经过去两年了，世界各地已经恢复了和平。然而，当怪物再次开始出现在地球上时，事情并没有平静多久。与此同时，一系列神秘的闯入事件发生在世界各地的超级古代遗迹中。GUTSSELECT团队由新队长带领，准备展开调查。殊不知，这是一场生死未卜的激战之始。GUTSSELECT和泽塔奥特曼在真中剑悟的带领下加入战斗。一个邪恶的身影从阴影中出现：邪恶特利迦，一个继承暗影的邪恶巨人。为了让大家再次展露微笑，特利迦奥特曼和泽塔奥特曼的人间体夏川遥辉与GUTSSELECT的新成员以及黑暗特利迦的人间体伊格尼斯将展开一场光与影的终极之战。