一颗外太空陨石撕裂长空砸落在印度尼西亚附近的一座孤岛上，此岛有个名字叫“幽灵岛”，而降落地附近随着气浪冲击散去以后，一个不起眼的地方显露出来几颗巨型蛋化石，随着时间的推移，陨石释放的放射性元素影响着岛内的动植物。零零散散矗立着的化石蛋壳表面一片沉寂，不仔细观察不会发现上面有一条细微的裂痕出现，东南亚某大学教授杜峥为了寻找幽灵岛，雇佣雷子探险团队以及逼迫动植物学家雪莉·赵，一同踏上了去往幽灵岛的路途，然而等待他们的将是未知的危险。

本片讲述了地质学家赵启明成功发现了一座神秘的幽灵岛，他带队上岛考察，却全军覆没，无一人生还。此后10年，赵启明的女儿赵雪莉，继承了父亲的衣钵，成长为一名优秀的科学家，她从未放弃追寻幽灵岛的下落以及当年科考队的真相。与此同时东南亚富商都哲对传说中的陨石垂涎不已，他胁迫赵雪莉同自己合作，组成了一支临时科考队，登上了幽灵岛。当科考队以为这只是一次普通的冒险之时，却遭遇了前所未有的危机——幽灵岛上竟生活着侏罗纪时期的恐龙。