铁时空的大战仍未止息，为了保护雷婷，大东委托东城卫首席战斗团团长修带着她先行回到金时空，自己与夏天并肩作战对抗魔界大军，雷婷万般不舍地离开大东。没想到修和雷婷在回金时空的路上却意外遇伏击分散，雷婷失踪！ 而此时终极一班群龙无首，辜战与止戈两兄弟为了当老大展开比武对决。修找到了终极一班，雷婷失踪引发了轩然大波，经过众人努力终于找到雷婷，让她重回老大位置。却发现她性情大变，原来这一切都是一场骗局……

故事延续《终极一班2》结尾中，被改变的金时空未来接续开始。 由于金时空的未来已被雷婷和中万钧改变，因此在本剧中，战力指数和K.O榜也回归。呼延觉罗·修告诉汪大东灸舞盟主新下的指令，要汪大东调查金时空最近战力指数异常飙高的现象， 所有线索都指向芭乐高中，所以盟主传汪大东回去调查的原因，虽然汪大东已经28岁了而且也不想回芭乐高中， 但是汪大东高中并没有毕业，也没有反对盟主的权利，所以只好回芭乐高中继续就学。新的故事也要展开了……

本剧讲述了大东奉盟主之令护送刘备回铁时空，但在过程中发生时空共震，被剧烈冲击力撞击的大东，睁开眼睛，发现自己竟然躺在女子更衣室的椅子上。从金宝三口中得知自己已消失了十年，而在此期间父母以及亚瑟和小雨为寻找自己而下落不明……

到底什么是好人， 什么是坏人，有标准答案吗？ 这是由一场无差别杀人事件，延伸出的几个家庭间，不同立场、不同参与者的故事……. 因孩子罹难濒临破碎的受害者家庭 ，儿子杀人于是避逃人群的加害者家庭 ，弟弟患病带给姐姐人生课题的家庭 ，这是一个，可能发生在「我们」每个人身边的故事。当事件发生，我们会选择如何面对？