2031年，刘雷昂作为当事人，亲历了“翔龙危机”——量子反应堆失控及其带来的一系列灾难。地球环境激变，动植物、机械异常进化，特异生物“B.R.A.I”诞生，人类被逼到了灭绝的边缘。此后七年，为了对抗B.R.A.I，遭到流放的雷昂不离不弃，在市郊与“家族契约”妹妹可依相依为命，坚持着研究。一次战斗中，他出于无奈驾驶实验机上阵，歪打正着地挽回了城防军的败局，被召回与一群性格各异的人组成“潘多拉”特种部队，保卫人类最后堡垒——“绝对防御都市”新翔龙。从此，关乎人类生死存亡的一场场恶战波澜壮阔地展开……

在现代日本生活的“本须丽乃”，在决定就职于自己所心愿的图书馆的那天去世了。想去读更多的书，抱着这样的念想的她，意识到的时候，已经拥有了异世界幼女清醒的身体并恢复了意识。故事的舞台是由拥有魔法力量的贵族们所统治的中世纪异世界的都市エーレンフェスト。在严格的身份制度中，拥有现代日本知识的少女梅茵，为了得到书而奋斗。梅茵终于要正式成为神殿的见习巫女。在进入神殿之前，她忙着向班诺报告各种事情，举办试吃会等。进入神殿的那天，斐迪南为梅茵举办宣誓仪式，她正式成为了蓝衣巫女。并且被命到她身边伺候的人是…

在我熟睡正酣的时候，忽然响起了某个人的叫骂声。我的名字叫奥芬。本职工作是魔术士，同时还在做非法放贷的兼职。破口大骂的人是名叫博鲁坎的地人小鬼。这家伙明明借了我的钱，却丝毫没有还钱的意思。 这个小鬼似乎说他找到了赚大钱的方法。虽然听上去不怎么可靠，但我暂且还是按他说的盛装打扮了一番，来到某家大财主的豪宅……就在那里，我遇到了那个家伙——

1800年前，人类恶念凝聚而成的怪物—八歧大蛇肆虐人间，被以草薙家族为首的武术家们用三件神器封印。现代，世界综合格斗大赛 - THE KING OF FIGHTERS（简称KOF）召开，全世界的格斗高手集聚南镇。草薙家族的传人-草薙京来到南镇之后，他敏锐地感觉到了大蛇之力的复苏，一切迹象表明KOF大赛背后隐藏着一个巨大的阴谋...

全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。在文明遭到毁灭的石头世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，一定要赶上这科学史的200万年差距！前所未闻的创世冒险谭，就此开幕！