距今超过六千年的远古世界，天地割裂的凄惨战争持续不断，毫无还手之力的人类被拥有强大力量的各个种族逼入绝境，濒临灭亡。此时率领人类的年轻领袖里克，与机凯种少女休比偶然相遇。被同伴抛弃的休比，为了修复故障，拜托里克把“人类的心”告诉自己。机凯种少女的单纯与真诚，使得里克对休比逐渐放下戒备、敞开心扉，二人感情亦日渐升温。最终二人带领人类共同面对终极一战，少女休比也将面临恋人与生命的残酷抉择。末日来临，在251秒的时间里，赌上一场深情告白。

在京都居住的内向男高中生直实（北村匠海 配音）的面前，突然出现从10年后穿越而来26岁的自己（松坂桃李 配音）。未来的直实告诉他，自己不久便会与琉璃（滨边美波 配音）相爱，可是之后烟花大会时她却会因为一场事故意外离世。 　　为了拯救爱人，16岁的直实卷入了这场现实与虚拟的记忆世界，经历了一系列超乎想象的事情。即使世界毁灭，我也想再见你一面。

时代背景设定在世界变动率为“1.048596%”的2019年。在这样一个机器人已经普遍实用化的未来，种子岛中央高校的“机器人研究部”八汐海翔和濑乃宫秋穂为了避免被废部，正在以“完成巨型机器人”为目标奋斗着。然而某天，海翔发现了一份名为“君岛报告”的A.R.笔记。在这份笔记里面，记录着名为君岛安科的人将会把整个世界都卷进来的大阴谋。

表面看来，九之濑宙太只是一个平凡的初中生，但实际上，他常常能够听到别人听不到的声音，这一特质困扰着他，导致他的个性十分软弱和自卑。一天，宙太突然被告知，他被选中成为了宇宙警探elDLIVE中的一员。实际上，有很多宇宙人潜伏在人类之中，宇宙警探就是为了维系宇宙人和人类之间的平衡所创办的组织。 就这样，毫不起眼的宙太肩上担负起了沉重的任务，宇宙共生体多尔成为了他的搭档。个性飞扬跋扈好胜心强的贝罗妮卡、成熟稳重略微有些害羞的妮诺奇嘉，和宙太一起声张正义的还有这些可爱的女孩们。

因父亲失踪继承财产的伊庭斋（伊庭いつき）本是个幼年时右眼失明且性格胆小的高中生，可在父亲的遗产中却有一所奇怪的商社会社公司，专门出借“魔法使”？！诚惶诚恐的他小小年纪就当上了二代目社长开始了新的“人生”。面对成堆见也没见过的工作，一直被同事嘲笑，还时不时接到莫名其妙的挑战状使得伊庭斋终日泪流满面。