《刑警队长》根据南通市公安局刑警支队原支队长顾瑛等干警的事迹改编。上世纪九十年代初江海市，担任派出所所长的顾铭，热衷于办案。公安分局局长吴剑南力排众议，把并不是科班出身的顾铭提拔为刑警队长。顾铭上任之初就大胆提出“命案必破，不破不休”，结果他上任后遇到的第一起命案就成为无头案。挫折面前，顾铭并不气馁，在此后的十几年里，他由担任区公安分局刑警队长，到担任市局刑警支队长，始终奋战在刑侦破案第一线...

1936年，日寇紧逼华北。十年前因枪杀青岛兴安帮主薛安泰成名的九龙商会少爷韩志杰，因母亲被日舰炸死而对日仇视；他出其不意夺回被日商藤泽强占的码头，本想借码头贩毒走私的藤泽视韩志杰为眼中钉。薛安泰遗女萧岚忍辱接近韩志杰想报父仇，机缘巧合却与韩志杰相恋；九龙商会大佬曾念安因利要杀韩志杰；韩志杰的好兄弟厉辰星因萧岚也与其反目，韩志杰陷入重重杀局，九死一生，然而萧岚却舍生忘死帮他化险为夷。不料在韩志杰和萧岚新婚之时，韩家却遭藤泽灭门，并嫁祸萧岚，有情人反目成仇。七七事变爆发，韩志杰和萧岚在中共的引导下，放下恩怨，投身抗日洪流。

秦文天（王志飞饰）和海兰（万茜饰）是经济发展银行的同事，上下级关系，两家对门而住，关系融洽。秦文天一家三口过着殷实的幸福生活：秦文天年轻有为，仕途平顺；妻子谢婉婷（孙茜饰）是个温婉娴静的妇产科医生。对门而住的海兰一家，老公孟三力（祖峰饰）是出版社的编辑，有着小康之家的闲适温馨。然而，秦文天意外的“撞人”事件，把秦文天和海兰卷入了绯闻的漩涡； 外来务工人员梁红把“撞人”事件的视频发到网上，秦文天为舆论焦点，海兰为其召开新闻发布会。为感谢《新财经》的公正报道，海兰给好友蔡娟介绍公司的同事游弋，俩人一见钟情。副行长黄有良陷害秦文天，安排《财富天下》报道海兰与秦文天有绯闻，引起轩然大波。谢婉婷曾经的闺蜜王萍，当年抢了谢婉婷初恋男友韦豪出国，成了著名美女作家，却得了宫颈癌，王萍回国想求得谢婉婷原谅，却遭遇了谢婉婷的冷眼相向。孟母催促要孩子，海兰和孟三力去谢婉婷医院做检查，化验结果孟三力患有死精症怀孕概率为零，他没有将病情告诉母亲和海兰。海兰怀孕了，孟三力和谢婉婷认为这个孩子是秦文天的，孟三力与海兰离婚，海兰万分委屈。谢婉婷对秦文天产生猜忌。对门而住的两家彻底分崩离析。 最终在海兰好友薛鹏和游弋的帮助下拆穿了副行长黄有良陷害秦文天的真相，孟三力因拿错死精症检查结果，懊悔万分，通过种种努力得到海兰原谅。蔡娟得知韦豪就是谢婉婷的初恋、王萍的前男友后愤然离去，高速上遭遇车祸。韦豪在其病床前倾诉真情，二人冰释前嫌。王萍得到了谢婉婷的原谅，握着韦豪的手安详离世！

1937年12月，侵华日军继攻上海之后，在华中司令官松井石根大将的指挥下发动九个师团和一个飞行团的兵力，三面围攻民国首都南京，中国守军虽奋勇抵抗，但终因实力悬殊，在日军的进攻下节节败退，12月12日南京保卫战进入最惨烈的阶段，外围防线已经全部被日军突破，南京岌岌可危。国民党南京省党部宪兵五团少校、中共地下党员代号“独狼”，在一次锄奸行动中，为解救战友“八音盒”遭省党部宪兵队怀疑被关押，独狼与组织上失去联系。 一队日军扮作国军骗开南京中华门，守城国军发现上当后双方展开厮杀，独狼在监狱中听到外面的枪炮声，监狱围墙被炸出一个窟窿。狡猾的日军向城楼上奔去，浅野正二攻占中华门，日军指挥部收到信号后派主力攻向南京。独狼无处可去，他无法坐视不管，他捡到一支步枪，并冒充一名教导总队中校营长林杰森的身份。

一个被冯玉祥誉为”在北伐时与我共过患难”的青年军官，一个在中原大战的危机中救出蒋介石的勇将，一个统御桂系主力在正面战场奋战的抗日将领，一个在蒋介石身边参与最高机密的智囊，但，他同时又与周恩来保持着密切的单线联系。中共军事情报工作领导者李克农上将称他为” 隐形人......