故事会以《战国BASARA3》为蓝本，将“关原之战”设为舞台。彼时为群雄割据的战国乱世，高歌天下布武的大魔王织田信长，在本能寺遭遇心腹大将明智光秀的反戈讨伐。在信长阵亡后，拥有压倒性战力的丰臣秀吉成为一方霸主。另一边，奥州最强之人伊达政宗准备进军小田原城。随后，甲斐武田军队听闻伊达开赴进军的报告，真田幸村心生驰援战场的冲动……

在与为了实现“天下布武”，用武力及恐怖的施政冷酷地蹂躏他国的第六天魔王・织田信长，以天下为赌注展开的死斗之后——武田与上杉，在两军历来的合战之地・川中岛，双方大名武田信玄与上杉谦信为了一决雌雄，继续展开着激烈的攻防战。

　　故事发生在主人公藤岛鸣海十六岁那年冬天，他与同班同学彩夏卷入了怪异事件，帮助他们解开谜团的是尼特族的统御者、非普通的的尼特族侦探爱莉丝。后来得知这位自称尼特侦探的紫苑寺有子（爱丽丝）是家里蹲，在“NEET侦探事务所”里且总穿着睡衣。主人公、紫苑寺有子（爱丽丝）、尼特族及尼特族侦探团为解开谜团而出动了……

四大公爵家贝薩流士家下一任当家奥茲?贝薩流士，在15岁的成人的仪式中因他的存在为罪名，把他推进阿嵬茨这个黑暗监狱中。奧茲在阿嵬茨中与称为染血黑兔的 “艾莉丝”相遇，并与她订立契约，成功逃出阿嵬茨。回到现实世界的奥兹发现这是10年后的未来世界，艾莉丝为了追寻失去的记忆，而奥兹则是为了寻找出自己的罪名，两人一同加入了潘朵拉组织，故事也就此正式展开……

花园花铃是一个普通的中学一年级生。父母在小时候过世，与她的叔母单独居住，但是不擅长运动的她总是被叔母骂。但在她心爱的宠物猫──小西过世之后，她的运气开始慢慢的转好。花铃很快发现她的母亲的遗物，一枚神秘的粉红色戒指，借由维纳斯女神的神力的帮助下（其实是由戒指产生出来的力量），可以让她变成维纳斯女神。之后她亦开始帮助九条和音寻找其他的戒指，尝试破解关于“神化”的谜题。