阿不思·邓布利多教授意识到强大的黑巫师盖勒特·格林德沃正试图夺取魔法世界的控制权。邓布利多了解仅凭他一人之力，将无法阻止格林德沃，于是他委托魔法动物学家纽特·斯卡曼德带领一支精良的团队——成员包括男巫、女巫及一位勇敢的麻瓜面包师，来共同执行这项危险任务。一路上他们会遇到各式各样的神奇动物，既有老朋友，也有前所未见的神秘生物；同时他们也随时会与格林德沃不断壮大的追随者发生冲突。这次行动的风险是如此之高……邓布利多还能袖手旁观多久？

该片讲述邓布利多知道格林德沃想要统治魔法世界，他招募了纽特·斯卡曼德带领一个团队去执行一项危险的任务，他们将因此遇上新老神奇动物。

讲述在1862年，热气球驾驶员Amelia Wren和科学家James Glaisher踏上了一段非凡的旅程，去寻找天堂的奥秘。在飞行过程中，他们的飞行高度突破了世界纪录，也有了令人惊叹的发现。然而当他们即将达到大气层时，被迫为了生存而展开史诗般的斗争。

1862年，热气球飞行家艾米丽亚.雷恩与科学家詹姆斯.格莱舍乘坐热气球展开了一场非凡的高空冒险，试图探寻天堂的奥秘。在飞行过程中，他们挑战了人类从未乘热气球抵达的高度，却也陷入一场史诗般的生存之战。

虽然纽特（埃迪·雷德梅恩 Eddie Redmayne 饰）协助美国魔法部将邪恶的黑巫师格林德沃（约翰尼·德普 Johnny Depp 饰）捉拿归案，但最终格林德沃还是逃脱了禁锢，他来到了法国巴黎，一是为了集结信徒掀起革命，二十为了寻找同样藏匿在这里的克雷登斯（埃兹拉·米勒 Ezra Miller 饰），寄生在克雷登斯身上的默默然是帮助格林德沃实现野心的不可或缺的道具。 格林德沃的潜逃在整个魔法世界里都掀起了轩然大波，一时间草木皆兵。邓布利多（裘德·洛 Jude Law 饰）秘密的找到了纽特，希望他能够前往巴黎，先格林德沃一步找到克雷登斯。和纽特一起踏上巴黎之旅的，是麻鸡雅各布（丹·福格勒 Dan Fogler 饰），他此行的目的，是要找回先前因为吵架而来到巴黎投奔姐姐蒂娜（凯瑟琳·沃特森 Katherine Waterston 饰）的恋人奎妮（艾莉森·苏朵儿 Alison Sudol 饰）。