《誓言今生》以我反间谍人员黄以轩和台湾情报官孙世安两人长达五十年的斗争为主线，以这两人为代表的两岸秘密斗争以及间谍和反间谍的殊死搏杀为主要内容，通过曲折复杂的故事情节和层层推进的悬念逐一展开。同时，剧情围绕黄以轩和孙世安之间的复杂渊源与千丝万缕的关联，在上海，香港，北京等地的广阔空间里，展现两个人物及家庭的复杂命运。

民国年间，张千月（杨坤锐饰）新婚之后进省城投奔同乡王明堂（李运佳饰），不成想晚上房间内发现床下有一个死尸，大批警察带走了旅社老板宋成安（周舟饰）、老板娘翠姐（黄娟饰）、住客顾满仓（王渊饰）、孙兴福（王正佳饰）、梁程思（刘锦饰）、门房老胡（季李饰）及房间内的张千月与王明堂。乡下的新婚妻子白秀英（何乙轩饰）与老父亲张广林赶至省城听审，老父亲接受不了这个严重的打击气绝身亡。这里面有不可告人的秘密。传说冤魂索命，这个事情不简单。一间旅馆、一个女尸、一群平民引发了一个意料之外的故事，展现了民国时期，灰暗的年代，军阀割据，官匪勾结，生活在社会底层的各种普通百姓，挣扎在水深火热之中，各种生活的无奈与社会现实的交织，人为了生存所做的一切挣扎.....一个投亲的少女灵芝（张依珂饰）引发了当地恶霸朱天久（李延饰）皮三（边防饰）残忍杀戮，牵扯无辜百姓，勾结当地警长康大鹏（周小鹏饰）利用贪官（高果饰）歪曲事实，残害无辜百姓，法官（常征饰）（杜伯饰）命悬一线。关联人李婉儿（李一明饰）四散逃命，江湖骗子（孔庆三饰）浑水摸鱼。更牵动大批爱国志士（许诺饰）（张玥饰）刺杀大帅庞金龙（张京海饰）督军孙连胜（吕一丁）为百姓申冤报仇！这一切的来龙去脉都由一名说书人（徐福来饰）娓娓道来。

香港葵涌码头装卸区，货柜车司机许城亮(古天乐 饰) 等载货北上，开始一天的工作。 港穗高速公路旁有一间由小夫妻张谦（印小天 饰）和陆茵(黄奕 饰) 打理的小餐馆。 夜深，张谦踏着摩托车回家，途中接到陆茵的来电，没留意迎面一辆高速货柜车驶来，把他连人带车撞倒，原来该货柜车司机就是城亮。凌晨，张谦宣告不治。此时陆茵更发现怀了身孕，丈夫却离世了，她决定把孩子生下来，并重开餐馆艰苦经营，继承亡夫的事业。事隔月余，城亮终于鼓起勇气走进陆茵打理的餐馆用餐，更在女友苏珊(莫文蔚饰) 体谅下，不时主动帮忙店内杂务，两人渐成好友。后陆茵发现城亮就是撞死丈夫的货柜司机，她怒气地看着城亮被张谦弟张军痛打致重伤…… 城亮回到香港家中，却被苏珊讥讽他自讨苦吃，两人大吵一场，苏珊感到城亮的心已离自己而去。陆茵进院生产，城亮得悉跑到医院并守在她身旁，陆茵感动，但她深信城亮对她只是一种责任不是爱情，她把餐馆结束，带儿子回家乡重过新生活，并请城亮回到其女友身边。城亮尝试回到自己过往的生活，却发觉一切都不复从前。他终于跟苏珊分手，再回国内找寻他相信的东西，但餐馆已经关门，电话号码也改了，中国那么大，要到那里才找到陆茵……

军阀混战的年代，九岁的女孩玉环目睹了亲生父亲与军阀张天心在争斗中落败身亡，玉环的母亲含恨而亡。从此，玉环和弟弟百顺在父亲的旧部汤学仁一家的照顾下长大，但不可磨灭的是她心中永远的家仇。12年过去了，军阀张天心从军长做成了大帅，在弱女子玉环面前他越来越强大，越来越难以接近。但是，玉环在一步一步按自己的设计逼近目标，她尝遍了人世的悲凉，当她的复仇愿望就要实现时，日本关东军打进了东北。张天心，这个一辈子在刀尖上行走的军阀拒绝了日本人收买，随之而来的内忧外患，令他疲于应付。此时玉环已有机会和能力刺杀张天心，但面对家仇与国恨的选择，玉环毅然走上了民族救亡的道路。

1991年，来自韩国的射箭高手申崇焕带着女儿申真依、申真慧正观摩中国的奥运会国内选拔赛。申崇焕告诉两个女儿，3号选手将是爸爸打入奥运会后最重要的对手，话音未落，3号在遥遥领先的情况下最后一环脱靶，失去了前往奥运会的机会，举座震惊。幼小的申真依目睹了一个男孩哭着冲出场去，那男孩是夏磊。