木幡真琴是15岁的魔女，从横滨来到了日本东北地区的青森，开始进行魔女的修练。她带著黑猫奇多，住进了远房亲戚阿圭的家，也转学到当地的学校，开始在这座小镇里生活。虽然她现在的魔法程度只会坐竹扫帚飞在天上，但是她还是很努力的学习。除了拔曼陀罗草做成草药之外，真琴也开始开拓了一小块田地，打算准备要种植蔬菜。

纽约崩坏后，一夜之间便架构成“赫尔沙雷姆兹·罗特”这个城市。在连系着异世界与现世界的这个魔都里，有个为了保持世界的平衡而在暗地里非常活跃的组织——秘密结社莱布拉！！少年雷欧在一连串的巧合下，加入莱布拉，他身上所隐藏的秘密将会对莱布拉造成什么影响…！？