泽塔奥特曼是赛罗奥特曼的徒弟，拥有着和赛罗一样的热心肠，是一位非常积极向上的奥特英雄。而且，泽塔非常崇拜他的师父赛罗。赛罗虽然嘴上不承认这个徒弟，但其实心里还是很看好泽塔的。这次和泽塔奥特曼有关的人类，是一位名叫夏川遥辉的热血青年。遥辉是怪兽应对机甲部队“军械库”的一名队员。在很久很久以前，由于某种原因，宇宙中出现了一种叫恶魔碎片的东西，它可以让怪兽失去理智。一个神秘的家伙正借助这些恶魔碎片危害四方，并将其魔爪伸向了光之国。赛罗和他的徒弟泽塔为了守卫家园，主动出击迎战敌人。一场激战过后，泽塔被迫与赛罗分开，独自一人追逐逃跑的怪兽。泽塔抵达地球的时候，遇到了正在战斗的遥辉。两人的相遇，拉开了故事的序幕。

被称作奥特黑暗杀手的黑暗魔人，具有创造奥特战士的黑暗战士的能力。赛罗奥特曼和格丽乔奥特曼落入了黑暗杀手之手。 为了应对这场危机，泰罗奥特曼召集了“新世代英雄”，银河奥特曼、维克特利奥特曼、艾克斯奥特曼、欧布奥特曼、捷德奥特曼、罗索奥特曼、布鲁奥特曼，以及银河救援部队的利布特奥特曼作为辅助。 “新世代英雄”与“黑暗军团”之间的战斗将开始。

路基艾尔、埃塔尔加等曾经的奥特战士宿敌接连苏醒，神秘的黑暗奥特战士也相继登场。新生代英雄们遭遇了不测，是谁在背后操纵着这一切？

朝仓陆等人从伽古拉那得知巨大人工头脑吉尔巴利斯企图抹杀全宇宙的智慧生命体，它为了寻找“赤钢”准备向地球发起进攻。为了阻止吉尔巴利斯，小陆等人来到了冲绳寻找“赤钢”，并在那里遇到了库西亚人比嘉爱琉，在她的带领下，他们终于在石像前找到了“赤钢”，然而小陆却无法令“赤钢”觉醒。就在此时，吉尔巴利斯手下的加拉特隆军团出现了，它们向冲绳发起了攻击。小陆变身成捷德奥特曼与欧布奥特曼、赛罗奥特曼一起对抗敌人。 然而小陆却给了自己太大的压力，他认为自己一定要保护好众人，结果因鲁莽行事而败下阵来，欧布奥特曼与赛罗奥特曼为了保护他而被敌人击中。小陆一度因此丧失了自信，最后在众人的鼓舞下，他的终极形态觉醒了！手持终极升华器的捷德奥特曼终极形态向吉尔巴利斯发起了挑战！

在试图杀死整个宇宙的知识生活的无垠的敌人击退勇士超的力量，甚至是光，幸存下来的严酷命运基德奥特曼面对！地球的危机消退和数据缩减，欧布奥特曼，伽古拉和赛罗奥特曼现身！而Riku的热门感觉唤醒了基德进入终极形式的终极决赛！最强的武器·Giga终结者提高节拍！它继续摧毁星采用智能化的生活居住着巨大的人工智能Girubarisu和，Gyaraku特隆兵团是一个全球性的办法。基德奥特曼朝仓陆，Girubarisu“红钢”来到地球，并从伽古拉那听到的，它是有线索的南大洋去了天堂·冲绳。会在冲绳岛相见吧，你看通过朝仓陆是基德奥特曼，面对Takuso一个重大使命。在朝仓陆的面前说Kiou超过必要保护地球红凯欧布奥特曼的出现，是把他作为前辈。在另一方面，攻击冲绳Gyaraku特隆军团开始寻求“深红钢”。基德，欧布，和赛罗奥特曼也去了地球。而要坚持自己的使命，不耐烦基德的行为，是导致在美国奥特曼进一步危机。