《神秘失踪的船》讲述了解放战争时期，宋庆龄通过海外华侨将一大批军需药品秘密运往国内，然而船行至东海突然失踪。我党中央立即派人查找，国民党也出动海、陆、空军前往搜杏。原来药品船被舟山群岛海盗司令方大雨劫持。海盗们不知箱中是何物，方大雨欲请恋人海曼的父亲弄清这批货。当他赶到鱼乡小镇，发现海曼的父亲惨遭地方女匪首王八妹的毒手致伤，海曼也被绑架。方大雨将自己儿子托付法华寺方丈，只身回到岛屿。我党特派员鲁平化装成郎中，走街串巷打昕失踪船只的下落．不幸落入匪手。侦察员小郭巧妙地救出鲁半和海曼一同找方大雨。狡诈的王八妹派人暗中跟踪。万大雨感谢鲁平他们救了海曼，却始终不提归还药品的事。尾随而来的王八妹与国民党官员朱天龙对方大雨软硬兼施，欲夺药品，骑虎难下的方大雨只好趁黑夜率众离岛。老谋深算的朱天龙料定方大雨会携子而逃，于是在法华寺设下伏兵将方大雨擒获，欲将他慢慢沉入海底。

1937年12月13日，时为国民政府首都的南京城沦陷，部分官员弃城逃亡，但仍有许多官兵留守，誓死保卫这个大厦将倾的城池。宋锡濂部军官陆剑雄协同战友与日军展开了激烈的巷战，他们微弱而顽强的抵抗最终被压制，数以万计的中国军民成为俘虏，在枪炮声中血染长江；金陵女子学院安全区，女教师姜淑云奔波往复，尽力帮助和拯救所有来此避难的同胞，但兽性大发的日军早已虎视眈眈盯上了藏身于此的妇女；拉贝的秘书唐先生小心应付，委曲求全，为了保护家人而做出错误的选择，他也为此付出代价；舞女小江纵使逃亡避难也不愿抛却女性的柔媚，她在关键时刻的选择则在其女性的外壳下注入一份刚强；日本人角川随部队进驻这个千疮百孔、破败不堪的城池，在这个人间炼狱，他的心灵感受到前所未有的巨大冲击。狼烟滚滚，血流成河，大时代的背景下，人们既要承受时代的无情给予，也要做出攸关命运的痛苦抉择……

原本对生活怀有希望的吴子晗，在遭遇命运不公后彻底发生转变，他的身影渐渐消失在那栋阴森恐怖的房子里，黑暗深处他始终被恶魔缠身，周而复始要寻找一个可以附身的躯体，摆脱恶魔，但远远没有那么简单……

受了三年牢狱之苦的徐达文，出狱后找到了自己飞黄腾达的孪生兄弟徐达武，久别重逢的两兄弟相见后却因金钱纠纷反目成仇，就从这一天开始，两人的命运也彻底发生了转变，先是不约而同的遭遇了各种离奇的恐怖事件，随后又常常的感觉到身边好像始终有一双诡异的眼睛窥视着自己。 而这发生的一切似乎都指向了三年前的那一次“意外”，女大学生丽丽因突发状况失足滑倒，不幸身亡，徐达文因过失致人死亡罪，被轻判入狱三年。冤有头，债有主，这接二连三发生的怪事和那阴魂不散的双眼，究竟是死去的丽丽回来找他们索命，还是另有其人从中搞鬼，这场看似简单的“意外”则成为他们深陷死亡泥沼的肇因，而两人刻意隐藏了三年的“秘密”也渐渐的浮出了水面…

影片根据中国古代神话故事《山海经》所记载的周饶小人国传说改编而成，讲述了周饶小人国的王子锤木，在意外之中闯下大祸，导致父亲变成石像，最后一路经历冒险，重新拯救了父亲和王国的故事。