小智和皮卡丘等一行伙伴在旅途中前行。某日，宝可梦波尔凯尼恩从天而降并被迫与小智锁在了一起。波尔凯尼恩与被人类伤害过的宝可梦们共同生活，因此非常讨厌人类，但这条神奇的锁链却让他们无法分开，奇妙的故事就此开始。小智与皮卡丘又将一起开始新的冒险…… 另一方面，在超级机关城市阿佐特王国，大臣贾维斯得到了常年追求的终极发明——500 年前诞生于阿佐特王国的人造宝可梦玛机雅娜。据说在玛机雅娜体内，有被称为 “魂心”的未知力量，贪婪又邪恶的贾维斯企图利用这股力量来统治王国。小智和波尔凯尼恩将会如何化解彼此的嫌隙？波尔凯尼恩与玛机雅娜又有着怎样的渊源？他们要如何共同对抗贾维斯拯救阿佐特王国？玛机雅娜的最终命运又将如何结局？一场精灵宝可梦史上最伟大的战役即将展开！

厌恶魔术的魔术讲师所展开的叛逆英雄幻想剧！ 魔术与科学共同发展的世界——卢瓦佛斯。位于魔导大国·阿尔扎诺帝国南部的“阿尔扎诺帝国魔法学院”，是学习世界最先端魔术的最高峰学舍。拥有约四百年历史的这所学院，是所有有志于魔术之道人们的憧憬，学院的讲师和学生们也因自己的身份而自豪。 突然来到这所正统学院赴任的非常勤讲师，葛伦·雷达斯。“我来教给你们真正的魔术吧”被称作“不正经”的这个男人的破天荒授课，就此开始。

她只会对我偷偷地笑。对方可知白草是获得了芥见奖的现役女高中生作家！而且是美少女！我知道她和我——普通高中生丸末晴是不般配的！不过，我觉得她对我是有感觉的，大概，啊不，是绝对！本是这么想的……却得知可知有了男朋友？！面对消沉的我，娇小可爱、爱照顾人……更直言不会喜欢我的青梅竹马志田黑羽对我说道……“复仇吧。”初恋之怨比海更深……但是绝不黑暗！绝不错综复杂！初恋复仇开始行动！

讲述主人公小智揭开从来没有任何人看到过的传说中的神兽Zygarde隐藏的秘密，并且与神秘组织“闪光团”展开激战的故事。小智的精灵甲贺忍蛙出现了不可思议的变化。

一群普通的孩子为了复活一个古老的守护者红龙，努力拼搏成为英雄。瓦凯和他的朋友周游世界寻找战斗光盘，让他们能够召唤强大的神兽进行史诗般的战斗。为了成为真正的英雄，他们必须上英雄学院，面对各种野生怪物，和同学们战斗来收集最多的战斗光盘。但邪恶的魔王轨道想要利用战斗盘的力量统治银河系。我们的英雄不得不与时间赛跑，与他们殊死搏斗。推翻魔王对整个银河的威胁，保护阿尔尼亚星球。使用火、水、木和风的力量，瓦凯和他的同学们将与强大的怪物们进行惊心动魄的战斗，学习勇气、友谊和忠诚的真正含义。他们将成为当之无愧的英雄。