夜幕笼罩下的东京霓虹闪烁，在城市某个不起眼的角落，充满温情的深夜食堂悄然开张。妖媚的川岛玉子（高冈早纪 饰）一脸颓唐，她的靠山不久前去世，却没给她留下分文遗产。在她无助的时候，貌不惊人的上班族小初（柄本时生 饰）走入玉子的视野，他们的关系迅速拉近。乡下女孩栗山美知留（多部未华子 饰）独自来到东京，走投无路之际她在老板（小林薰 饰）这里吃了霸王餐，事后主动登门要求打工还钱，女孩因此找到了暂时的栖身地。3·11大地震让福岛灾民大石谦三（筒井道隆 饰）和来自东京的志愿者杉田明美（菊池亚希子 饰）相识。大石对其展开狂热的追求，甚至尾随来至东京。 　　平凡人的小故事，在深夜食堂内交替上演……

2012年的一个夜晚，自幼在某孤儿院长大的矢口敦也（山田凉介 饰）、小林翔太（村上虹郎 饰）和麻生幸平（佐藤宽一郎 饰）对某女企业家实施了抢劫，由于汽车意外抛锚，他们仓皇逃到了一家早已关门的杂货店内躲藏。这家名为浪矢杂货店的铺子此前由风趣和善的老人浪矢雄治（西田敏行 饰）经营，数十年前他出于玩笑帮小朋友们解答各种困扰，后来名气越来越大，以至于有人专程向他咨询人生中的难题。本来从1980年就该沉寂的店铺，却在三人闯进来后收到了烦恼咨询信。随后敦也等人发现，这些信件竟然来自遥远的过去。神秘的夜晚，迷途青年执笔为他人排忧解难，他们的命运和这家解忧杂货店紧紧联系在了一起……

相河一辉（高桥一生饰）在大学教授研究动物行为的“动物行为学”，半年前刚开始讲师的生活，但是他太喜欢各种生物，沉迷于研究，甚至不遵守大学的规则，每天都在职场挨批，而且他不太遵守时间，还被牙医吐槽没常识。一辉非常诚实，有时对学生的提问直接回答不知道，让学生困惑，他坚持兴趣，不守固定观念的样子也影响了身边人的价值观。

改编自荣获芥川奖的作家藤泽周同名原著，讲述境遇截然不同的两个男子，一起练剑的故事。剑道五段的矢田部研吾（绫野刚 饰）因某件事变得终日酗酒自甘堕落，成了某大楼的保安。他的母亲亡故，父亲则背负着“使用杀人刀的手”……。某天研吾认识了喜欢rap的高中生羽田融（村上虹郎 饰），发现他和自己父亲一样是天生的剑士，故事由此展开……

「一天又结束了，当人们赶路回家的时候，我的一天才正式开始。菜单只有牆上写的这些，你也可以点你想吃的，我做得出来就帮你做，这就是我的经营方针。营业时间从午夜十二点到早上七点，人们称这儿叫『深夜食堂』。你问会不会有客人来？喔，还不少喔！」 　　安倍夜郎的作品《深夜食堂》以都会区巷弄裡从深夜开始营业的食堂为舞台，将老闆做出的平民料理，与形形色色的客人的故事融合，时而温馨时而忧愁，不仅散发料理的香气，也洋溢最质朴的人情味。 　　不管是黑道大哥的纯情回忆、半红不黑演歌女歌手奋斗史，或是AV男优与家庭的羁绊，都在食堂老闆做出一道道平凡但美味的料理后，故事就展开了。每一集剧情把主轴放在各个阶层、不同身份的客人身上，用人与人的关係将故事连结，用料理带着故事前进，看着看着甚至觉得阖上书本，拿着钱包下楼，走到巷口转角，深夜食堂就在那裡亮着暖暖的黄光，等着你光临。