Phi-Brain是指拥有黄金比大脑之人,而主人公的大门界人则是Phi-Brain的候补者之一。在界人揭开贤者之谜和愚者之谜之后,便获得了"Solver"的指名。于是大门界人与青梅竹马的井藤野乃叶以及其他拥有解答者身份的同伴们一起,与神秘团体POG和Orpheus Order展开解谜对决。

NHK Eテレで放送されているテレビアニメ『ファイブレイン ～神のパズル』の第2シリーズ制作が決定。第2シリーズでは、カイトの前に、新たな敵“オルペウスオーダー”を名乗る少年たちが出現する。

本作是以解谜为题材的原创动画，Phi-Brain是指拥有黄金比大脑之人，而主人公Kaito作为Phi-Brain的候补者之一，为解开传说中的“神之谜题”而展开一场冒险。 热爱解谜的私立√（Root）学园高一学生大門Kaito，在偶然的机遇下挑战了潜藏在学园近郊地下遗迹中的“不可解之谜”，那是由神秘的智囊集团POG所制造的、招致生命危险的“贤者之谜”。被真相激怒的Kaito漂亮地攻克了贤者之谜，意外地从中获得了“Solver(解答者)”的指名。于是Kaito与青梅竹马的少女Nonoha以及其他拥有解答者身份的同伴们一起，以存在于世界各地的“贤者之谜”为舞台，与POG展开解谜对决。

沢渡枫幼年时不幸的失去了父亲，在悲痛中，坚强的她决定拾起父亲最爱的相机，通过摄影来完成对父亲的回忆和思念。在某一次拍摄中，枫偶然发现了一种名为“玉响”的光芒，为了捕捉这能够让人得到幸福的神迹，枫彻底的走上了摄影的道路。 这一天，枫来到了父亲曾经生活过的小镇竹原市，在这里，她要开始她崭新的高中生活。在学校里，枫结识了一群个性可爱的朋友们，枫决定要用相机为她们制造出最美丽的玉响。一段单纯快乐的...